（1）．中小学心理健康教育的学科化倾向
有些学校把心理健康教育纳入到学校的正规课程中，当作一门学科来对待；心理健康课的内容当作心理学的概念理论来讲述，还安排学生进行心理健康课的考试。殊不知，心理健康课是为了帮助学生解决在学习、生活、人际关系方面的烦恼，帮助他们减轻心理负担，让他们轻轻松松地学习。但是由于考试的压力，反而使学生身心健康易受到一定程度的伤害。一味地追求学科化，使心理健康教育流于形式，难以达到心理健康教育的真正目的。
（2）．中小学心理健康教育的医学化倾向
有人认为心理健康教育就是进行心理咨询和心理治疗，“治疗”和“指导”意识较强，选择学生心理障碍问题的较多，选择发展性问题的较少；把中小学心理健康教育医学化，违背了心理健康教育的本质要求和内在规律。有的学校让校医充当心理辅导人员，像医院里记录病历一样来对学生情况进行登记；不少学校的领导、教师对学生进行了错误的宣传，使学生认为只有当心理有疾病时才能去心理咨询室，这种医学化的倾向已经严重阻碍了中小学心理健康教育的顺利进行。根据临床个案和调查统计，有心理疾病、心理障碍的学生人数不到学生总数的1％。这就是说，中小学生的心理从总体上来说是健康的，只是在发展过程中遇到了一些适应性问题，不能和医学意义上的心理疾病、心理障碍简单地混为一谈。
