目标教学实验中也遇到了不少的困难和挫折，出现过不少的偏差和问题。对这些情况，我们要面对现实，敢于正视，并且要在不断的克服困难和挫折中、解决问题和偏差中，不断求得突破，求得发展。例如：

1．加重师生负担问题。实验初期，课前教帅婪制定白标，学生要预习自达部分低层次目标，课后要补救失误。有时还要刻印资料或制作图表，加重了师生的负担。有些学校各科都同时开展起来，整个学校就承担不了。许多实验地区解决这个问题的主要方法，是由地市或省教研部门统一制定教学目标和检测资料，这可以减轻学校和教师的负担，也便于提高质量。但深层次的问题还是要提高课堂教学质量，有效地指导学生快速度高标准的达到教学目标，力争用尽可能少的时间，尽可能少的精力，尽可能少的经费，获得尽可能大的效益。在现代社会中，任何不讲效益的思想理论和实践方案，都是不会被人们接受的。

2．形式主义问题。实验初期，某些实验者由于对目标教学的基本理论掌握较差，所以抓不住本质，有某种形式主义倾向。例如学习外地经验是比葫芦画飘．运用于自己的实际时实效不大。又如课堂教学中应用反馈矫正的手段比较生硬，近于机械化操作，缺乏生动活泼的气氛。对于实验过程中出现的各种问题，我们既不能求全责备，也不能坐视不理。惟一正确的态度是，加强理论学习，注意继承和借鉴，不断增强实验的科学性。湖南省岳阳市教科所，指导实验者“由形似人格到神似出格，再到形神兼备”的发展方向，是一条现实的路。所谓“人格”，就是在充分继承和广泛借鉴的基础上形成自己的常规。

形式主义往往是由于缺乏理论深度，特别是缺乏对民族传统的继承所造成的。观察他们的实验或者阅读他们的文章资料往往有这种感觉：有高涨的热情，但缺乏充分的依据。甚至有人把目标教学想象得像诗歌的意境那样美妙，以为照抄照搬几句原理和模式就可以奏效。这可能是他们的实验还不够深入，还没有领略其中的矛盾、斗争和艰辛，其中又多数是一些涉世未深而又充满幻想的年轻同志。对于这些同志我们也从诗人那里借来两句话奉送；真理使激情实在，激情使真理闪光。