在诸多的课程问题中，课程价值的研究应是学科教育研究者首先关注的问题。为什么呢?学科教育的研究者有一个不自觉的倾向，那就是他们研究的出发点会受到自身所从事的学科结构模式的影咱。这就是在实践上把学科和学科教育混为一谈的倾向。学科是学科专家设计的在学科领域内归结了人类文化遗产的专门的学问体系，而学科教育则研究给予不同资质、不同能力、不同目标的学习者以什么样的学习内容和智能发展的要求。前看属于学科研究的范畴，而后者属于教育研究的范畴。前者的研究会偏重于学科知识的自身，而后者的研究会偏重于学科知识对于学习者的价值。笔者曾经对近几年发表的学科教育研究的论文做过一些粗略的分析，发现有的学科教育论文中作知识性介绍的竞达80％以上。真正在探讨学科教育价值的，以及如何去实现学科教育价值的论文，真可以说是风毛鳞角。

不同的学科自有其教育的价值，同一门学科也会由于学习者自身的差异而要求有不同的价值。在课程研究的历史上曾经有过人文主义和自然主义之争。人文主义课程论者强调入文课程能陶冶人的情操，自然主义课程论者则强调自然课程是人类享受高度物质文明之源，反映出不同学科的不同价值理念。在实行多元化课程体制的国家里，同一门学科往往有好几种不同的教材，它们也往往反映出课程设计者的不同价值理念。